地牢中的宝箱分为两大类：黄金宝箱和环境宝箱。黄金宝箱需要使用黄金钥匙开启，钥匙可通过地牢怪物掉落或从罐子中随机获取。环境宝箱则需要对应的生物群落钥匙，这些钥匙需通过击败特定BOSS后收集材料合成。地牢宝箱内含有游戏各阶段的重要武器和装备，是玩家提升战力的关键来源。
环境宝箱共有五种，分别对应不同生物群落：神圣宝箱、丛林宝箱、冰雪宝箱、腐化宝箱和血腥宝箱。每种宝箱需要对应的钥匙开启，例如神圣钥匙需在神圣之地刷怪获得模具，再结合世纪之花掉落的神庙钥匙与机械三王的灵魂合成。这些宝箱内的武器具有鲜明的环境特性，例如神圣宝箱的彩虹枪能发射持续伤害的彩虹光束，丛林宝箱的食人鱼枪可召唤自动追踪敌人的食人鱼。
开启环境宝箱的核心难点在于钥匙材料的收集。模具的掉落率极低，需在对应生物群落长时间刷怪。机械三王的灵魂需要通过击败毁灭者、双子魔眼和机械骷髅王获取。宝箱钥匙的合成必须在秘银砧或山铜砧旁进行，且开启宝箱时钥匙无需装备，只需存放在背包即可自动消耗。
地牢宝箱的武器设计注重战术多样性。腐化宝箱的腐化灾兵能分裂出小型吞噬者造成范围伤害，冰雪宝箱的冰霜九头蛇杖可放置自动攻击的冰霜雕像，血腥宝箱的吸血飞刀兼具远程攻击与生命恢复功能。这些武器虽非终极装备，但在特定战斗场景中能发挥不可替代的作用。建议在击败骷髅王并具备中级装备后再尝试深入，地牢守卫会在未满足条件时秒杀玩家。环境宝箱通常分布在地牢深处，寻找时需留意墙体颜色与宝箱外观的对应关系。合理利用宝箱武器可大幅降低后期BOSS战难度，但需根据战斗需求选择开发顺序。
